MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 plasmid pXFAS01

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010579	GGC	2	6	9439	9444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010579	CGT	2	6	9477	9482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010579	TGC	2	6	9556	9561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010579	TAA	2	6	9602	9607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010579	T	6	6	9651	9656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010579	TCTT	2	8	9690	9697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010579	ATC	2	6	9711	9716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010579	ATT	2	6	9733	9738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010579	TTCCTC	2	12	9801	9812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010579	GCA	2	6	10676	10681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010579	CGC	3	9	10757	10765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010579	TGA	2	6	10809	10814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010579	GA	3	6	10859	10864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010579	TTTG	2	8	10932	10939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010579	GTT	2	6	10971	10976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010579	GAG	2	6	11015	11020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010579	GGC	2	6	11029	11034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010579	AGAT	2	8	11744	11751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010579	AAC	2	6	11791	11796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010579	ATC	2	6	11900	11905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010579	CTT	2	6	11910	11915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010579	T	6	6	11914	11919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010579	A	6	6	11924	11929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010579	TAA	2	6	11958	11963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010579	CGG	2	6	12008	12013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010579	CTAA	2	8	12043	12050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010579	GAG	2	6	12051	12056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010579	GC	3	6	12675	12680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010579	GC	3	6	12694	12699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010579	T	6	6	13066	13071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010579	A	6	6	13076	13081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010579	TAA	2	6	13110	13115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010579	CGG	2	6	13160	13165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010579	CTAA	2	8	13195	13202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010579	GAG	2	6	13203	13208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010579	CTTA	2	8	13825	13832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010579	CAT	2	6	14473	14478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010579	CT	3	6	26411	26416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010579	TTC	2	6	26796	26801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010579	GCG	2	6	26809	26814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010579	GAA	2	6	26878	26883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010579	T	7	7	26993	26999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010579	ACCA	2	8	29647	29654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010579	TAGA	2	8	29678	29685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010579	AGTT	2	8	29697	29704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010579	T	7	7	31920	31926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010579	TCA	2	6	32042	32047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010579	TTA	2	6	33855	33860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010579	CAAG	2	8	33875	33882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010579	GCTT	2	8	33889	33896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010579	ATT	2	6	34005	34010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010579	TCTA	2	8	34016	34023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010579	T	6	6	34030	34035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010579	ATTT	2	8	34171	34178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010579	G	11	11	34202	34212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010579	G	9	9	34227	34235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010579	G	9	9	34261	34269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010579	G	6	6	34333	34338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010579	TGA	3	9	34368	34376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010579	G	7	7	34380	34386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010579	TGA	3	9	34416	34424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010579	G	6	6	34428	34433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010579	TGA	3	9	34463	34471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010579	G	10	10	34475	34484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010579	TCC	2	6	34541	34546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010579	AGT	2	6	35485	35490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010579	TCC	2	6	35853	35858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010579	A	6	6	36324	36329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010579	AAAGA	2	10	36346	36355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010579	CTT	2	6	36770	36775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010579	T	6	6	36774	36779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010579	TATCA	2	10	36785	36794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010579	TA	3	6	36815	36820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010579	AT	3	6	36879	36884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010579	GAA	2	6	36924	36929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.